La microbiota és el conjunt de microorganismes que es troben a tot el cos humà. Hi ha una relació simbiòtica amb aquests microorganismes invisibles, és a dir, que tant l'individu com els microorganismes que hi habiten treuen un benefici mutu d'aquest allotjament. Aquests microorganismes poden ser bacteris, virus, i fongs, entre d'altres.

Es creu que aquesta colonització comença al moment del part, on la mare passa part de la seva microbiota al nadó pel canal vaginal. A partir d'aquell moment, la microbiota comença a formar-se, assolint la maduresa sobre els tres anys, moment en què ja s'assembla a un adult. És important recalcar que la microbiota va evolucionant al llarg de la vida de mica en mica, ja que és altament susceptible de ser modulada per l'ambient que envolta l'individu. La lactància materna, l'entorn, els antibiòtics, la dieta i les possibles al·lèrgies són alguns dels factors que afecten i modulen la composició de la microbiota, la qual és única i irrepetible, com la genètica de cada persona.

L'exemple més clar d'aquesta simbiosi és la microbiota intestinal. L'intestí es troba colonitzat per milers de milions de bacteris, amb la major part localitzats a l'intestí gruixut. Més de 400 espècies de bacteris conviuen a l'intestí, cadascun d'ells amb unes característiques diferents. S'estima que, en conjunt, la microbiota intestinal suposa més de 3 milions de gens, és a dir, 150 vegades més que el genoma humà. Tota aquesta genètica bacteriana confereix una sèrie d'avantatges a l'hospedador dels quals no podria beneficiar-se si no fos pels bacteris del seu intestí. Per exemple, gràcies a elles es poden digerir fibres complexes o sintetitzar vitamina K. Una altra funció important de la microbiota intestinal és l'activació del sistema immune i el seu paper defensor, ja que impedeix que altres microorganismes patògens s'assenten i proliferin, podent generar malestar o malaltia.

No obstant això, com que és altament modulable, el conjunt de diversos factors externs pot afavorir un creixement de bacteris poc beneficiosos per a l'organisme generant un estat de disbiosi intestinal. La disbiosi es refereix a l'estat de desequilibri en el nombre o tipus de bacteris a l'intestí, i alguns dels seus símptomes gastrointestinals poden ser males digestions, inflor i/o gasos. Per aquest motiu, és fonamental portar una dieta saludable que ajudi i afavoreixi el creixement de bacteris bons. Per això, cal consumir fruites i verdures diàriament, prioritzar els llegums com a font proteica, evitar l'alcohol i el tabac, reduir el consum de sucre i farines refinades, i prendre aliments probiòtics com el iogurt o el quefir. Mantenir una microbiota sana, equilibrada i diversa és